意思是“只留下了敲钟击磬的声音”。

首先我认为“余钟磬音”不是一个成语，这是唐代常建《题破山寺后禅院》诗中的一句，原句为：万籁此都寂，但余钟磬音。意思是“此时此刻万物都沉默静寂，只留下了敲钟击磬的声音”。

但余：只留下。一作“惟余”，又作“唯闻”。
钟磬（qìng）：指钟、磬之声。磬，古代用玉或金属制成的曲尺形的打击乐器。

只留下了敲钟击磬的声音。这句话出自唐代常建的《题破山寺后禅院》。原文：清晨入古寺，初日照高林。

曲径通幽处，禅房花木深。

山光悦鸟性，潭影空人心。万籁此都寂，但余钟磬音。常建的《题破山寺后禅院》，构思独具特色，它紧紧围绕破山寺后禅房来写，描绘出了这特定境界中所独有的静趣。

常建的《题破山寺后禅院》“万籁此都寂,但余钟磬音”,禅院的钟磬之音袅袅传来不绝于耳,有赖于万物之音全部消失,禅院的空寂可见一斑,这以声静来衬写自己的心静,抒发自己万念俱寂的出世的思想感情.